초록 미생물군집 조사에서 샘플 보존은 특히 원거리 지역에서 여전히 도전 과제입니다. 샘플을 건조하면 냉장 체인과 방부제의 필요성을 없앨 수 있지만, 동결 건조와 같은 정교한 탈수 도구는 현장에서 실용적이지 않습니다. 또한 샘플 건조가 유전자 중심 메타유전체학 및 메타유전체 조립 유전체(MAG) 회복과 같은 현대 분석에 미치는 영향은 잘 이해되지 않고 있습니다. 여기에서는 열 보조 샘플 탈수 후 실온에서 보관하는 것을 현장에서의 비용 효과적이고 실용적인 솔루션으로 탐색합니다. 우리는 3개 위치의 토양과 3종의 동물의 대변으로부터 얻은 60개의 샘플을 사용하여 일반적인 메타유전체 및 16S rRNA 증폭체 서열 분석에서 얼리는 것에 대한 영향을 평가합니다. 우리는 DNA 추출 성공, 염기서열 분석, 컨티그 조립, OTU 클러스터링, 유전자 주석 및 MAG 회복 등 여러 지표를 고려하고, 추론된 미생물 군집 구성에 미치는 영향을 평가합니다. 우리는 탈수가 DNA 추출 성공성에 관련된 여러 지표에 중대한 부정적 영향을 미쳤지만, OTU 풍부도, 샤논 다양성, 유전자 주석 및 MAG 회복과 같은 하위 지표에 미치는 영향은 더 미묘하고 종종 중요하지 않다는 것을 발견했습니다. 더 나아가, 보존 방법은 추론된 미생물 군집 구성에 중대한 영향을 미쳤지만, 서로 다른 출처의 샘플(예: 서로 다른 위치의 토양이나 서로 다른 개체의 대변)은 명확하게 구별되었습니다. 우리는 열 보조 탈수가 냉동 샘플과 높은 일관성을 요구하지 않는 미생물 연구에 적합한 샘플 보존 방법이 될 수 있다고 결론지었습니다.
Mullin et al. (Sun,) 이 질문을 연구했습니다.