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TDP-43은 전두측두엽 퇴행성 질환(FTLD) 및 근위축성 측삭 경화증(ALS)에서 포함체를 형성하는 주로 핵에 존재하는 RNA 결합 단백질입니다. 인체 뇌에서 TDP-43의 mRNA 표적과 RNA 처리에서의 역할은 대부분 알려져 있지 않습니다. 개별 뉴클레오타이드 해상도의 자외선 교차 결합 및 면역 침강(iCLIP)을 사용하여 TDP-43이 생체 내에서 UG-풍부 서열의 긴 클러스터에 선호적으로 결합한다는 것을 발견했습니다. FTLD 환자의 뇌에서 TDP-43의 RNA 결합 분석은 결합의 가장 큰 증가가 MALAT1 및 NEAT1 비코딩 RNA에 있음을 나타냈습니다. 또한 TDP-43의 전사체(pre-mRNA)에 대한 결합이 Nova 단백질과 유사한 위치 의존적 방식으로 대체 스플라이싱에 영향을 미친다는 것을 발견했습니다. 더불어, 우리는 침묵된 엑손 하류의 깊은 인트로닉 위치에 TDP-43 결합의 비정상적으로 긴 클러스터를 확인했습니다. TDP-43에 의해 조절되는 상당한 비율의 대체 mRNA 아이소폼은 신경발달을 조절하는 단백질을 인코딩하거나 신경학적 질환과 관련이 있으며, 이는 뇌에서 스플라이싱 조절에 대한 TDP-43의 중요성을 강조합니다.
Tollervey et al. (Sun,)은 이 질문을 연구했습니다.