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여러 보고서에서는 산림 토양 샘플이 농업 토양 샘플보다 더 많은 문(phylum)을 포함하고 있다고 강조했습니다. 그러나 산림 토양의 박테리아 군집의 구조와 풍부성에 대해서는 알려진 바가 거의 없습니다. 고급 차세대 454 피로시퀀싱을 활용하여, 우리는 참나무 뿌리 주변 틈새와 주변 토양을 식민지화하는 박테리아 군집의 다양성을 깊이 조사했습니다. 세 개의 공간적으로 독립적인 토양 샘플에서 우리는 300,000개 이상의 부분적인 16S rRNA 유전자 서열을 얻었습니다. 가장 풍부한 박테리아 그룹은 산호세균(Acidobacteria), 프로테오박테리아(Proteobacteria) 및 분류되지 않은 박테리아였습니다. 다양한 문의 상대적 비율에 대한 다요소 분석은 뿌리 주변 및 토양 환경에 존재하는 박테리아 군집의 순차적 차별화를 밝혀내어 참나무 뿌리 주변 효과를 제안했습니다. 주변 토양에 비해 뿌리 주변에는 β-, γ- 및 분류되지 않은 프로테오박테리아가 유의미하게 더 많이 서식했습니다. 반대로, 일반 토양에서는 뿌리 주변보다 유의미하게 더 많은 분류되지 않은 박테리아가 검출되어, 토양이 여전히 복잡성의 도전적인 저장소임을 나타냅니다. 이 연구는 박테리아 다양성에 대한 틈새 효과와 토양에 서식하는 희귀한 계통군에 대한 우리의 이해를 높입니다.
Uroz et al. (Tue,)은 이 질문을 연구했습니다.