망간 의존성 슈퍼옥사이드 디스뮤타제 유전자의 염기서열 분석을 통한 Streptococci의 종 수준 확인

우리는 다양한 스트렙토코쿠스 유형 균주(S. acidominimus, S. agalactiae, S. alactolyticus, S. anginosus, S. bovis, S. constellatus, S. canis, S. cricetus, S. downei, S. dysgalactiae, S. equi subsp. equi, S. equi subsp. zooepidemicus, S. equinus, S. gordonii, S. iniae, S. intermedius, S. mitis, S. mutans, S. oralis, S. parasanguis, S. pneumoniae, S. porcinus, S. pyogenes, S. salivarius, S. sanguis, S. sobrinus, S. suis, S. thermophilus, S. vestibularis)의 망간 의존성 슈퍼옥사이드 디스뮤타제를 인코딩하는 유전자의 약 85%를 나타내는 내부 조각(sodA(int))을 특성화하기 위해 변이 프라이머를 사용한 PCR 분석을 사용했습니다. 이러한 sodA(int) 조각의 계통 분석은 16S rRNA 염기서열로 구성된 나무와 유사한 형태의 진화 나무를 형성합니다. 우리는 임상 분리균주가 유형 균주의 sodA(int) 조각의 계통 나무에서 그들의 sodA(int) 조각의 위치를 결정함으로써 식별될 수 있음을 보여주었습니다. 우리는 기존의 표현형 반응을 바탕으로 종에 할당할 수 없는 균주를 특성화하기 위한 이 방법을 제안합니다.