약물 분자의 결합에 대한 절대 자유 에너지의 정확한 계산

결합 친화력의 정확한 예측은 수십 년 동안 계산 화학의 중심 목표였지만 여전히 달성이 어렵습니다. 좋은 진행이 있었음에도 불구하고, 약물 발견 맥락에서 사용하기 위한 필수 정확도가 약물 유사 분자에 대해 일관되게 달성되지 않았습니다. 여기에서는 브로모 도메인 포함 단백질 4(BRD4)에 결합하는 다양한 억제제 세트에 대한 열역학적 사이클을 기반으로 절대 자유 에너지 계산을 수행하고 0.6 kcal mol-1의 평균 절대 오차를 달성할 수 있음을 보여줍니다. 또한 유사한 수준의 정확성(1.0 kcal mol-1)을 의사 예측 접근법에서도 달성할 수 있음을 보여줍니다. 브로모 도메인은 아세틸화 모티프를 인식하고 유전자 전사를 조절하는 에피제네틱 표지 리더이며, 현재 암과 염증에 대한 치료 표적으로 조사되고 있습니다. 전례 없는 정확성은 약물 유사 화합물의 결합 자유 에너지를 약리학적으로 관련된 표적에 대해 예측할 수 있다는 흥미로운 가능성을 제공합니다.