AnimalTFDB 3.0: 동물 전사 인자 주석 및 예측을 위한 포괄적 자원

Animal Transcription Factor DataBase (AnimalTFDB)는 동물 전사 인자(TFs)와 공동 인자에 대한 가장 포괄적이고 정확한 정보를 제공하기 위한 자원이다. AnimalTFDB는 7년 동안 유지 관리되었으며 개선을 계속할 것이다. 최근 우리는 데이터와 기능을 향상시키기 위해 AnimalTFDB를 버전 3.0 (http://bioinfo.life.hust.edu.cn/AnimalTFDB/)으로 업데이트하였다. AnimalTFDB는 97개 동물 유전체에서 125,135개의 TF 유전자와 80,060개의 전사 공동 인자 유전을 포함하고 있다. 데이터 양의 확장 외에도 몇 가지 새로운 기능과 기능이 추가되었다. 이 새로운 기능은 다음과 같다: (i) 더 정확한 TF 계열 할당 규칙; (ii) 전사 공동 인자의 분류; (iii) TF 결합 부위 정보; (iv) 인간 TF와 관련된 GWAS 표현형 정보; (v) 22개 동물 종에서의 TF 발현; (vi) 뉴클레오타이드 서열에 대한 잠재적인 결합 TF를 식별하기 위한 TF 결합 부위 예측 도구; (vii) 인간 TF를 더 잘 활용하기 위해 설계된 별도의 인간 TF 데이터베이스 웹 인터페이스(HumanTFDB). AnimalTFDB의 새 버전은 TF와 공동 인자에 대한 포괄적인 주석 및 분류를 제공하며, TF 및 전사 조절 연구에 유용한 자원이 될 것이다.