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여기에서는 아스페르질루스 푸미가투스 분리주를 구별할 수 있는 새로운 정확한 타이핑 분석을 위한 짧은 반복 (STR) 패널을 설명합니다. 총 아홉 개의 STR 마커가 이용 가능한 유전체 A. fumigatus 서열에서 선택되었고 세 가지 다채로운 멀티플렉스 PCR로 나누어졌습니다. 각 멀티플렉스 반응은 각각 세 개의 이-, 삼- 또는 사뉴클레오타이드 반복을 증폭했습니다. 이 아홉 개의 STR 마커를 사용하여 100개의 추정 비관련 A. fumigatus 분리주를 분석했습니다. 각 마커에 대해 이 집단에서 11개에서 37개의 대립 유전자가 발견되었습니다. 하나의 분리주는 최소한 두 개의 서로 다른 분리주의 혼합으로 판별되었습니다. 남아있는 99개의 분리주로부터 96개의 서로 다른 지문 프로파일이 얻어졌습니다. 개별 마커에 대한 심슨 다양성 지수는 0.77에서 0.97 사이였습니다. 이-, 삼-, 및 사뉴클레오타이드 반복의 멀티플렉스 조합에 대한 다양성 지수는 0.9784에서 0.9968 사이였습니다. 모든 아홉 개 마커의 조합은 0.9994의 심슨 다양성 지수를 생성하여 이 새로운 유전자 좌위의 높은 변별 능력을 나타냅니다. 이론적으로, 이 마커 패널은 적어도 27 x 10(9)개의 서로 다른 유전형을 구별할 수 있습니다. 다채로운 멀티플렉스 접근법은 많은 수의 마커를 짧은 시간 내에 시험할 수 있게 합니다. 이 분석의 정확한 성질은 높은 재현성과 결과의 쉬운 교환을 결합하여 대규모 역학 연구를 위한 매우 적합한 도구로 만듭니다.
Valk 외 (Mon,)는 이 질문을 연구했습니다.