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천연물은 합성 화합물 및 약물에 비해 다양하지만 특정한 분자적 특성을 가진 이질적인 화합물 집합이다. 모든 관련 분석 결과는 천연물이 실제로 사용 가능한 스크리닝 컬렉션으로 탐색되지 않은 화학 공간의 일부를 차지하고 있음을 보여주며 동시에 주로 '다섯 가지 규칙'을 준수하고 있음을 나타낸다. 이는 천연물이 약물 발견에 사용되는 스크리닝 라이브러리의 귀중하고 독특하며 필요한 구성 요소가 됨을 의미한다. ChemGPS-NP 웹과 Scaffold Hunter는 생물학적으로 관련된 NP 화학 공간 탐색을 집중적이고 목표 지향적으로 안내하여 새로운 합성 접근 방식을 이끌기 위해 과학 커뮤니티에 제공되는 두 가지 도구이다. 제공된 여러 예시는 컴퓨터 방법과 화합물 라이브러리 합성 간의 간극을 연결하는 가능성과 화학 정보학, 화학 공간 분석을 합성 화학 및 생화학과 통합하여 단백질 기능의 새로운 소분자 조절제를 성공적으로 식별하기 위해 화학 공간을 탐색하는 가능성을 보여준다. 이러한 예들은 또한 생물 의학 연구 및 약물 발견을 위한 화학 공간 개념과 현대 화학 합성의 시너지 잠재력을 보여준다. 화학 공간 분석은 충분히 탐색되지 않은 생물학적으로 관련된 화학 공간 부분을 매핑하고 이러한 부분을 차지하는 구조 유형을 식별할 수 있다. 그런 다음 현대 합성 방법론을 적용하여 이 '가상 공간'을 실제 화합물로 효율적으로 채울 수 있다. 화학 정보학 관점에서 볼 때, 교육받은 비전문 화학자와 생물학자가 일상 연구에서 쉽게 적용할 수 있는 오픈 소스 도구에 대한 명확한 수요가 있다. 여기에는 웹에서 Scaffold Hunter, ChemGPS-NP 및 관련 접근법의 추가 개발이 포함될 것이다. 이러한 '화학 정보학 도구 상자'는 화학자와 생물학자가 전문적인 컴퓨터 과학 및 화학 정보학 지식 없이 직관적이고 매우 상호작용적인 과정으로 자신의 데이터를 채굴할 수 있게 해준다. 우리는 대규모 고처리량 스크리닝 캠페인을 기반으로 한 연구 이니셔티브, 특히 제약 산업에서 최근의 컴퓨터 도구의 발전을 최대한 활용하고 인하우스에서 생성된 대형 데이터 세트를 완전하게 활용하기 위한 유효하고 필요할지도 모른다고 예상한다. 이러한 데이터 세트에는 화학 및 생물학에 의해 식별되고 탐색되어야 하는 '구멍'이 있다.
Lachance et al. (Thu,)는 이 질문을 연구했다.