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마이크로RNA는 mRNA의 안정성과 번역을 조절하는 짧은 비암호화 RNA입니다. 마이크로어레이 또는 심층 시퀀싱 기술을 이용한 프로파일링 실험은 특정 조직, 발달의 특정 단계 또는 암과 같은 질병 상태에서 선호적으로 발현되는 마이크로RNA를 식별했습니다. 심층 시퀀싱은 대량 병렬 시퀀싱을 활용하여 주어진 샘플에서 수백만 개의 작은 RNA 서열 리드를 생성합니다. 심층 시퀀싱에 의한 마이크로RNA 프로파일링은 절대적인 풍부성을 측정하고 이전의 클로닝 및 표준 시퀀싱 노력에서 놓친 새로운 마이크로RNA를 발견할 수 있도록 합니다. 공공 데이터베이스는 다양한 알고리즘에 의해 마이크로RNA 유전자 표적에 대한 인실리코 예측을 제공합니다. 이러한 예측 중 어느 것이 진짜 양성을 나타내는지 더 잘 판단하기 위해, 마이크로RNA 발현 데이터는 유전자 발현 데이터와 통합되어 가설적인 마이크로RNA:mRNA 기능적 쌍을 식별할 수 있습니다. 여기에서는 심층 시퀀싱으로부터의 마이크로RNA 발현 데이터 분석을 위한 도구와 방법론에 대해 논의합니다.
Creighton et al. (Mon,)는 이 질문을 연구했습니다.
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