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고속 DNA 염기서열 분석 기술로 생성된 대규모 환경 데이터셋을 탐색하려면 자연 미생물 군집의 조성과 다양성에 대한 기본 재고 설명을 넘어서는 새로운 분석 접근 방식이 필요합니다. 미생물 군에 대한 잠재적 상호작용을 조사하기 위해, 중요한 군에 대한 동시 발생 패턴의 네트워크 분석이 공간적 또는 시간적 경량에서 복잡한 미생물 군집의 구조를 해독하는 데 도움을 줄 수 있습니다. 여기서는 151개의 다양한 생태계 유형의 토양 샘플에서 160,000개 이상의 박테리아 및 고세균 서열을 포함하는 16S rRNA 유전자 바코드 화이로시퀀싱 데이터셋에서 미생물 군 사이의 연관성을 계산하고 네트워크 분석 접근 방식을 적용했습니다. 결과로 나온 네트워크의 형태를 설명하고 풍부함과 점유율(즉, 서식지 일반주의자와 서식지 전문주의자)을 기준으로 운영 세분화 단위 카테고리를 정의했습니다. 일반적인 비무작위 연관, 넓은 세분화 수준에서의 공통적인 생애 역사 전략, 그리고 커뮤니티 구성원 간의 예상치 못한 관계를 포함하여 동시 발생 패턴이 간단히 드러났습니다. 전반적으로, 미생물 군집의 구조와 군집 조립을 이끄는 생태적 규칙에 대한 더 통합된 이해를 얻기 위해 군 간 상관관계를 탐색할 수 있는 가능성을 보여주었습니다.
Barberán 외 연구진(Thu,)이 이 질문을 연구했습니다.