건강한 기증자의 혈소판 전사체 풍경

혈소판 RNA 시퀀싱은 과학 공동체에서 점점 더 많이 사용되고 있습니다. 비정상적인 혈소판 전사체는 암이나 심혈관 질환에서 흔하지만, 건강한 개인의 혈소판 RNA 콘텐츠에 대한 참조 데이터는 부족하며 복잡한 조사가 필요합니다. 우리는 혈소판 전사체의 동력을 탐구하고자 했습니다. 204명의 건강한 기증자로부터 수집된 데이터 세트를 사용하여 스플라이스 변이체 분석을 수행했으며, 특히 나이, 성별, 혈액 저장 시간, 수집 단위 또는 라이브러리 크기와 관련하여 분석했습니다. B2M, PPBP, TMSB4X, ACTB, FTL, CLU, PF4, F13A1, GNAS, SPARC, PTMA, TAGLN2, OAZ1 및 OST4 유전자는 분석된 집단에서 가장 높은 발현을 보였으며, 상당한 전사 일관성을 유지했습니다. CSF3R 유전자는 남성에서 상향조절된 것으로 나타났습니다 (fold change 2.10, FDR q < 0.05). 중위수 나이에 따라 집단을 이분화했을 때, 노인 기증자에서 KSR1이 상향조절되었습니다 (fold change 2.11, FDR q < 0.05). 비지도 계층적 군집화 분석은 나이, 성별, 저장 시간, 수집 단위 또는 라이브러리 크기에 관계없이 두 개의 군집을 나타냈습니다. 그러나 기증자를 전반적으로 분석했을 때 (벡터로서), 성별, 저장 시간, 라이브러리 크기, 혈액 수집 단위 및 나이는 그룹 간 및/또는 그룹 내 변동성을 부여합니다. 건강한 기증자의 혈소판 전사체는 일반적인 일관성을 유지하며, 전경에서 벗어난 스플라이스 변이체는 매우 적습니다. 다차원 분석은 분석된 그룹 간 및 그룹 내에서 통계적으로 유의한 변동성을 보여주지만, 생물학적으로 이러한 변화는 미미하고 질병 분류를 고려할 때는 중요하지 않습니다. 우리의 작업은 건강한 혈소판 및 혈소판 전사체에 영향을 미치는 병리학적 조건에 대한 연구를 위한 참고 자료를 제공합니다.