Key points are not available for this paper at this time.
OrthoDB는 다양한 진핵생물, 원핵생물 및 바이러스 샘플링에 대한 유전자의 진화적 및 기능적 주석을 제공합니다. 유전체학은 유전자 다양성 탐구를 가속화하고 있으며, 상동성은 유전자 기능적 지식을 빠르게 확장되는 유전체 서열 우주와 연결하는 가장 정밀한 방법입니다. OrthoDB는 최고의 품질 유전체 데이터를 사용하여 가장 다양한 유기체를 샘플링하여 종 다양성의 선도적 범위를 제공합니다. 18,000개 이상의 원핵생물과 거의 2,000개의 진핵생물 및 1억 개 이상의 유전자에 대한 기초 데이터 업데이트는 범위를 새로운 수준으로 끌어올립니다. 이 성과는 상동유전자 구분을 위한 기본 OrthoLoger 소프트웨어의 확장성을 보여주며, 이는 https://orthologer.ezlab.org에서 자유롭게 이용 가능합니다. OrthoDB 릴리스에 사용된 유전자 상동성의 ab-initio 계산 외에도, OrthoLoger 소프트웨어는 새롭고 계산된 상동유전자에 매핑하여 해당 주석과 연결하는 기능을 제공합니다. OrthoLoger의 LEMMI 스타일 벤치마크는 최첨단 성능을 보장하며 https://lemortho.ezlab.org에서 이용할 수 있습니다. OrthoDB 웹 인터페이스는 모든 유전자에서 샘플링된 다른 종까지의 쌍별 상동성 뷰를 포함하도록 더욱 발전되었습니다. OrthoDB에서 계산된 진화적 주석 및 광범위하게 수집된 기능적 주석은 REST API 또는 SPARQL/RDF를 통해 접근할 수 있으며, https://www.orthodb.org에서 온라인으로 다운로드하거나 탐색할 수 있습니다.
Kuznetsov 외. (수요일,) 이 질문을 연구했습니다.