인간 폴리(C)-결합 단백질-2의 첫 번째 KH 도메인의 결정 구조와 인간 말단 DNA의 C가 풍부한 가닥의 복합체, 1.7 Å에서

포유류 세포에서 폴리(C) DNA 및 RNA 서열의 인식은 폴리(C)-결합 단백질(PCBP)로 알려진 KH(유전적 다양성 연관 단백질 K 유사성) 도메인 함유 단백질의 하위 계열에 의해 이루어진다. 폴리(C) 서열 인식의 분자적 기초를 밝히기 위해, 우리는 인간 C가 풍부한 가닥 말단 DNA의 한 반복에 해당하는 7개의 뉴클레오타이드 DNA 서열(5'-AACCCTA-3')과 복합체를 이루는 PCBP2 KH1의 결정 구조를 1.7 Å 해상도로 결정하였다. 단백질-DNA 상호작용은 수소 결합, 정전기적 상호작용, 반데르발스 접촉 및 형태적 보완성을 포함한 여러 안정화 힘의 조합에 의해 매개된다. 세 개의 사이토신 잔기에 대한 특정 인식은 두 개의 보존된 리신과 하나의 글루탐산의 측쇄를 포함하는 밀집된 수소 결합 네트워크에 의해 이루어진다. 공동 결정 구조는 또한 DNA 결합 홈의 반대쪽에 위치한 PCBP2 KH1의 단백질-단백질 이합체화 인터페이스를 드러낸다. 소수성 접촉, 방향족 측쇄의 스태킹, 그리고 많은 수의 수소 결합을 포함한 여러 안정화 단백질-단백질 상호작용은 단백질-단백질 상호작용 인터페이스가 실제로 진정할 가능성이 높음을 나타낸다. PCBP2 KH1과 인간 말단 DNA의 C가 풍부한 가닥 간 상호작용은 PCBPs가 텔로미어/텔로메라제 기능 조절에 관련된 메커니즘에 참여할 수 있음을 시사한다.