대뇌 피질의 교세포, 뉴런 및 혈관 세포에 대한 RNA-시퀀싱 전사체 및 스플라이싱 데이터베이스

뇌의 주요 세포 계열은 발달 과정, 대사, 신호 전달 및 기능에서 차이를 보입니다. 이러한 계열을 구성하는 세포들의 기능과 상호작용을 더 잘 이해하기 위해, 우리는 생쥐 대뇌 피질에서 대표적인 뉴런, 성상교세포, 희소돌기아교세포 전구세포, 새로 형성된 희소돌기아교세포, 수초화 희소돌기아교세포, 미세아교세포, 내피세포 및 주변세포를 급속 분리하였습니다. RNA 시퀀싱을 통해 이 여덟 개 세포 유형의 전사체 데이터베이스를 생성하고 각 세포 유형에서 대체 스플라이싱 사건을 감지하기 위해 민감한 알고리즘을 사용했습니다. 생물정보학 분석은 수천 개의 새로운 세포 유형 특이적 유전자와 스플라이싱 아이소폼을 밝혀내어 세포 식별 및 유전자 조작 도구, 그리고 뇌 생물학에 대한 통찰을 제공할 것입니다. 예를 들어, 우리 데이터는 뉴런과 성상교세포가 미토콘드리아 독특한 스플라이싱으로 인한 해당과정 효소인 PKM2 유전자의 공동 조절에 따라 해당 플럭스와 젖산 생성을 얼마나 역동적으로 조절하는지에 대한 단서를 제공합니다. 이 데이터셋은 뇌의 발달과 기능 연구를 위한 강력한 새로운 자원이 될 것입니다. 이러한 데이터셋의 널리 보급을 위해, 우리는 뇌 내 다양한 세포 계열의 전사 및 대체 스플라이싱 프로필을 분석하고 비교할 수 있는 사용자 친화적 웹사이트(http://web.stanford.edu/group/barres_lab/brain_rnaseq.html)를 만들었습니다.