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이 연구는 레이크 래니어(조지아주, 미국)에서 단기 플랑크톤 미생물 군집 구조와 회복력을 탐구하고, 동시에 16S rRNA 유전자 증폭체 및 메타유전체 염기서열 데이터를 통해 분류군을 식별하는 기술적 측면을 평가했습니다. 시간적으로 분리된 네 가지 샘플로부터 생성된 16S rRNA 유전자 증폭체는 454 GS-FLX-Ti로 염기서열 분석되었으며, 각 샘플에서 약 40,000개의 rRNA 유전자 염기서열을 생성하고 약 300개의 관찰된 OTU를 나타냈습니다. 동일한 생물학적 샘플에서 얻은 복제물은 함께 클러스터링되었지만, PCR 또는 염기서열 준비 단계와 관련된 몇 가지 편향이 관찰되었습니다. 동반 전체군 샷건 메타유전체 데이터셋과의 비교에서, 각 시점에서 추정된 OTU의 수는 일치했지만, 메타유전체에서 각각 1.5배 및 약 10배 더 많은 문과 속이 확인되었습니다. 우리의 분석은 16S rRNA 유전자가 시간에 따른 군집 다양성의 광범위한 변화를 포착하지만, 메타유전체 데이터에 비해 제한된 해상도와 낮은 민감도를 가진다는 것을 보여주었습니다. 또한 우리는 교란에 의해 분리된 네 개의 가까운 시점에서 상대적 풍부도의 유의미한 변화를 보인 OTU를 식별하고, 메타유전체와 16S rRNA 증폭체 데이터에서 이러한 분류군을 추적했습니다. 강한 여름 폭풍은 계절적 혼합보다 군집 구성에 덜 영향을 미쳤으며, 이는 유기체의 뚜렷한 계승을 드러냈습니다. 이 연구는 담수 미생물 군집에 대한 통찰력을 제공하고, 현장에서 군집 다양성 및 역학을 평가하는 접근 방식을 발전시킵니다.
Poretsky 외(화요일,)는 이 질문을 연구했습니다.