간암의 종양 내 이질성과 클론 진화

종양 생태계의 클론 진화는 주로 면역 및 치료에 의해 매개되는 다양한 선택 압력에 달려 있습니다. 우리는 간암 샘플의 여러 지역에서 RNA-seq, DNA 시퀀싱, TCR-seq 및 SNP 배열 데이터를 통합하여 암 세포와 면역 세포 간의 시공간 상호작용을 매핑합니다. 이러한 상호작용이 지역적 신형 에피토프와 바이러스 항원 부담을 지역적 적응 면역 반응과 상관시킴으로써 종양 내 이질성(ITH)을 어떻게 반영하는지 조사합니다. 주객 의 변이의 지역적 발현은 간염 B 바이러스와 암-고환 항원과는 달리 적응 반응을 주로 모집합니다. 우리는 동일한 종양의 먼 지역에서 적응 면역계의 서로 다른 클론 확장을 감지합니다. ITH 기반 유전자 서명은 단일 생검 환자의 생존 예측을 개선하며, 2명의 환자 7개 지역에서 38,553개의 단일 세포의 발현 조사는 간암의 이질성을 더욱 보여줍니다. 이 데이터는 전사체적 ITH를 계량화하고 HCC 생태계의 다양한 구성 요소가 암 진화 동안 어떻게 상호작용하는지를 나타냅니다.