MEGAN4를 이용한 환경 시퀀스의 통합 분석

환경 시퀀스 분석의 주요 과제는 데이터 통합입니다. 문제는 분류학적 및 기능적 측면을 모두 다루면서 서로 다른 유형의 데이터를 통합된 접근 방식으로 분석하는 방법입니다. 이러한 분석을 용이하게 하기 위해, 우리는 널리 사용되는 분류학적 분석 프로그램인 MEGAN을 대폭 확장하였습니다. 새로운 프로그램인 MEGAN4는 메타게놈, 메타전사체, 메타단백질, 및 rRNA 데이터의 분류학적 및 기능적 분석을 위한 통합 접근 방식을 제공합니다. 분류학적 분석은 NCBI 분류법을 기반으로 수행되며, 기능적 분석은 서브시스템 및 기능 역할의 SEED 분류 또는 경로 및 효소의 KEGG 분류를 사용하여 수행됩니다. 여러 예시가 이러한 분석을 수행하는 방법을 보여주며, 다른 도구를 사용하여 얻은 분류 결과를 가져와 비교할 수도 있음을 보여줍니다. MEGAN4는 학술 목적으로 무료로 제공되며, 모든 주요 운영 체제의 설치 프로그램은 www-ab.informatik.uni-tuebingen.de/software/megan에서 다운로드할 수 있습니다.