KofamKOALA: 프로파일 HMM 및 적응형 점수 임계값에 기반한 KEGG 유사체 할당

초록 요약 KofamKOALA는 프로파일 숨겨진 마르코프 모델(KOfam) 데이터베이스에 대해 동종성 검색을 통해 단백질 서열에 KEGG 유사체(KOs)를 할당하는 웹 서버입니다. KofamKOALA는 기존의 KO 할당 도구보다 빠르며 그 정확도는 가장 성능이 뛰어난 도구와 비슷합니다. KofamKOALA에 의한 기능 주석은 유전자와 KEGG 자원, 예를 들어 KEGG 경로 맵을 연결하는 데 도움을 주며 분자 네트워크 재구성을 촉진합니다. 가용성 KofamKOALA, KofamScan 및 KOfam은 https://www.genome.jp/tools/kofamkoala/ 에서 무료로 제공됩니다. 문의: ogata@kuicr.kyoto-u.ac.jp