박테리아 다양성의 기본 단위 식별: 박테리아 계통학에 생태학을 포함시키는 패러다임 전환

박테리아 생태학과 진화의 중심 질문은 자연 공동체 내의 방대하고 다양한 박테리아 세트에서 생태적으로 독특한 역할을 하는 그룹(에코타입)을 일관되게 구분할 수 있는 방법을 요구합니다. 이론 기반 가이드라인의 부족으로 인해 현재 박테리아 계통학의 방법은 생물의 박테리아 영역을 의미 있는 생태학 및 진화의 단위로 나누는 데 실패하고 있습니다. 우리는 박테리아 개체군의 진화 역학을 모델링하고 자연 공동체 내의 에코타입을 식별하기 위한 염기서열 기반 접근법(“에코타입 시뮬레이션”)을 소개하며, 여기에서는 이스라엘의 “진화 협곡”에서 조사된 두 개의 바실루스 클레이드에 초점을 맞춥니다. 이 접근법은 전통적인 종 내에서 여러 에코타입을 식별하였으며, 각 에코타입은 생태적으로 독특한 계통으로 예측됩니다; 많은 이러한 에코타입이 서로 다른 태양 노출을 가진 서로 다른 협곡 경사에 특화된 생태적으로 독특한 것으로 확인되었습니다. 에코타입 시뮬레이션은 미생물 생태학 및 계통학을 위한 오랫동안 필요했던 자연적 기초를 제공합니다.