TDP-43가 그 대응 mRNA의 3′UTR에 결합하면 용해성이 향상된다.

43 kDa의 TAR DNA 결합 단백질(TDP-43)은 TDP-43 단백질병으로 명명된 광범위한 신경퇴행성 질환의 병인에 연루되어 있으며, 이는 근위축성 측삭 경화증에서 전두측두엽 치매에 이르는 다양한 질환을 포함한다. 병리학적으로 잘못 접히고 응집된 형태의 TDP-43은 이러한 질병의 영향을 받은 뉴런의 세포질 포함체에서 발견된다. TDP-43의 잘못 접힘이 질병을 유발하는 기전은 잘 이해되지 않고 있다. 현재 가설은 TDP-43의 응집 과정이 병인에서 주요한 역할을 한다고 가정하고 있다. 우리는 그 가설을 확장하여, TDP-43에 대한 대응 리간드의 결합이 단백질의 본래 기능 상태를 안정화하고 응집을 완화할 수 있다고 제안한다. 우리는 대장균에서 N-말단 비너스 노란 형광 단백질 태그를 포함하는 재조합 TDP-43을 발현시키고 용매 염 농도를 변경하여 그 응집을 유도한 후, 다양한 올리고뉴클레오타이드 분자가 in vitro에서 응집을 얼마나 영향을 미치는지 응집 유도 탁도를 사용하여 조사하였다. 우리는 vYFP-TDP-43이 자연 발생 RNA 표적에 결합할 때, 즉 그 mRNA의 3'UTR 지역에 있는 서열을 포함하는 경우에 그 용해성이 향상된다는 것을 보여주며, 이는 TDP-43의 용해성, 올리고뉴클레오타이드 결합, TDP-43 자가 조절 간의 상호작용을 시사한다.