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유전체학은 유전체 및 메타유전체의 포괄적인 조사를 약속하지만, 빠르게 변화하는 기술과 확장되는 데이터 볼륨으로 인해 완전성 평가가 어려운 작업이 됩니다. 기술적 시퀀싱 품질 메트릭은 Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO, http://busco.ezlab.org)의 예상 유전자 콘텐츠 측면에서 유전체 데이터 세트의 완전성을 정량화하여 보완할 수 있습니다. 최신 소프트웨어 릴리스는 높은 처리량 평가를 용이하게 하기 위해 코드를 완전히 재구성하여 더욱 유연하고 확장 가능하게 만들었습니다. 원래의 여섯 가지 계통 평가 데이터 세트는 개선된 종 샘플링으로 업데이트되었고, 척추동물, 절지동물, 버섯 및 원핵생물에 대한 34개의 새로운 하위 세트가 구축되어 해상도가 크게 향상되었으며, 이제 선충, 원생생물 및 식물에 대한 데이터 세트도 제공됩니다. 여기에서는 BUSCO v3를 소개하며, BUSCO 평가의 광범위한 유용성을 강조하는 예제 분석을 제시합니다. 이는 유전체 데이터 세트의 품질 관리를 넘어 비교 유전체학 분석, 유전자 예측기 훈련, 메타유전체학 및 계통유전체학의 응용에 걸쳐 있습니다.
Waterhouse et al. (화요일)이 이 질문을 연구했습니다.