ASO의 타겟 RNA에 대한 친화성을 조사하기 위한 향상된 생물물리학적 스크리닝 전략

최근 새로운 RNA 치료제 발견의 급증은 새로운 타겟을 탐색할 수 있는 완벽한 환경을 조성했습니다. 특히, 항센스 올리고뉴클레오타이드(ASO)는 다른 RNA 기반 치료제에 비해 가속화되고 효과적인 약물 설계를 약속해왔습니다. ASO의 인 실리코 설계는 RNA 접힘을 위한 여러 예측 틀 덕분에 지난 몇 년간 뚜렷하게 발전했지만, RNA-RNA/DNA 서열을 기반으로 한 서열 친화성을 계산하는 데 있어 광범위한 근사로 인해 제한을 받습니다. ASO의 변형은 고려되지 않으며, RNase H1 매개 기전을 통해 기능을 발휘하는 ASO에 특히 기본적인 하이브리다이제이션 정보를 잃게 됩니다. 여기에서는 고처리량 차등 스캐닝 형광법(DSF), 원형 이탈 측정(CD), 등온 열량측정법(ITC), 표면 플라스몬 공명(SPR), 소각 X선 산란(SAXS)과 같은 여러 생물물리학적 기술을 사용하여 ASO의 타겟 RNA에 대한 친화성을 조사하기 위한 저렴하고 향상된 생물물리학적 스크리닝 전략을 제시합니다.