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이 연구는 계통유전 신호가 관련 종에서 샘플링된 계통유전 데이터에서 매우 가변적임을 보여주며, 대규모 게놈 및 전사체 데이터셋에 대한 종 나무 분석을 수행할 때 도전과제를 제기합니다. 이러한 복합 데이터셋의 갈등 및 프로세스에 대한 추가 통찰력이 필요하며, 시퀀스 분석 및 하위 응용을 위한 적절한 모델을 개선하고 개발하는 데 도움을 줍니다. 이 노력을 지원하기 위해 우리는 고유한, 갈등하는, 일치하는 이분할을 계산하고, 유전자 복제를 매핑하며, 내부 노드 확신(ICA) 점수 및 노드 특정 유전자 복제 수와 같은 요약 통계를 출력하는 오픈 소스 소프트웨어 phyparts(https://bitbucket.org/blackrim/phyparts)를 개발했습니다.
Smith et al. (Mon,)은 이 질문에 대해 연구했습니다.