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메타셀이란 단일 세포 염기서열 데이터를 바탕으로 한 세포 집합으로, 고도로 세분화된 뚜렷한 세포 상태를 나타냅니다. 여기에서는 단일 세포의 세포 상태 집합(SEACells)을 소개합니다. SEACells는 기존의 세포 클러스터링이 가리는 이질성을 유지하면서 단일 세포 데이터의 희소성을 극복하여 메타셀을 식별하는 알고리즘입니다. SEACells는 RNA와 전이효소 접근 가능한 크로마틴(ATAC) 양식 모두에서 이산 세포 유형과 연속 궤적을 가진 데이터 세트에서 포괄적이고 간결하며 잘 분리된 메타셀을 식별하는 데 있어 기존 알고리즘보다 우수한 성능을 보입니다. 우리는 SEACells를 사용하여 유전자 피크 연관성을 개선하고 ATAC 유전자 점수를 계산하며 분화 중 중요한 조절자의 활동을 추론하는 방법을 시연합니다. 메타셀 수준 분석은 대규모 데이터 세트에 확장 가능하며, 환자 집단에 특히 적합하여, 환자별 집합이 데이터 통합을 위한 보다 견고한 단위를 제공합니다. 우리는 메타셀을 사용하여 조혈 분화 동안 크로마틴 풍경의 발현 역학과 점진적 재구성을 드러내고, 질병 발생 및 중증도와 관련된 CD4 T 세포의 분화 및 활성 상태를 독특하게 식별합니다.
Persad 외. (Mon,)은 이 질문을 연구하였습니다.