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많은 게놈 시퀀싱 프로젝트의 목표는 추가 분석을 위한 기초 데이터로서 목표 게놈(또는 게놈들)의 완전한 표현을 제공하는 것입니다. 그러나 조립체에서 어떤 시퀀스가 실제로 목표 게놈으로부터 유래했는지, 어떤 것이 관련된 미생물 군집 또는 오염 유기체로부터 유래했는지 식별하는 것은 문제가 될 수 있습니다. 우리는 게놈 데이터 세트의 시각화, 품질 관리 및 분류학적 분할을 위한 모듈식 명령줄 솔루션인 BlobTools를 소개합니다. BlobTools는 시퀀스의 구아닌+시토신 함량, 시퀀싱 라이브러리의 판독 커버리지 및 시퀀스 유사성 일치의 분류학을 사용하여 데이터의 주요 분할을 지원할 수 있으며, 이는 조립체 개선 및 최종 조립체에서 잠재적 오염 물질을 스크리닝하는 데 기여합니다. 우리는 혼합된 다세포 생물 및 세균 분류군을 포함하는 시뮬레이션된 쌍끝 판독 데이터 세트를 통해 BlobTools의 주요 워크플로를 설명하고 저복잡도 메타게놈 조립체의 분류학적 분할을 위한 유용한 매개변수를 제안합니다.
Laetsch et al. (Mon,)는 이 질문을 연구했습니다.