마이크로어레이 데이터 보정 및 차등 발현 정량화에 적용된 분산 안정화

데이터 보정, 차등 발현 정량화, 측정 오차 정량화를 포함하는 마이크로어레이 유전자 발현 데이터에 대한 통계 모델을 소개합니다. 특히, 우리는 강도 측정을 위한 변환 h와 전체 강도 범위에서 분산이 대략적으로 일정한 차이 통계량 Deltah를 도출합니다. 이는 마이크로어레이 데이터에서 통계적 추론의 기초를 형성하고 다변량 분석을 위한 합리적인 데이터 전처리 전략을 제공합니다. 변환 h에 대해서는, 분산-평균 의존성 모델에서 유도된 매개변수 형태 h(x)=arsinh(a+bx)를 도출합니다. 강도가 클 때, h는 로그 변환과 일치하고 Deltah는 로그 비율과 일치합니다. h의 매개변수와 실험 간 보정 매개변수는 최대 우도 추정의 강건한 변형을 통해 추정됩니다. 우리는 두 가지 색의 cDNA 배열과 일련의 Affymetrix 올리고뉴클레오타이드 배열을 포함한 다양한 실험 플랫폼의 데이터 세트에서 우리의 접근법을 입증합니다.