CIRI: 효율적이고 편향되지 않은 de novo 원형 RNA 식별을 위한 알고리즘

최근 연구에 따르면 원형 RNA(circRNA)는 동물에서 풍부하고 안정적이며 어디에나 존재하는 새로운 클래스의 비부호화 RNA 분자입니다. 고처리량 전사체 데이터에서 circRNA를 포괄적으로 검출하는 것은 그들의 발생과 기능을 연구하기 위한 초기 및 중요한 단계입니다. 여기에서 우리는 여러 필터링 전략을 사용하여 전사체 데이터에서 circRNA를 편향되지 않고 정확하게 검출하기 위한 새로운 카이 스틱 클리핑 신호 기반 알고리즘 CIRI를 소개합니다. CIRI를 ENCODE RNA-seq 데이터에 적용하여 우리는 인간 전사체에서 내재적/유전자 간 circRNA의 유행과 이들에 특화된 조각들을 처음으로 식별하고 실험적으로 검증했습니다.