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질병 연관 SNP의 하류 효과를 식별하는 것은 도전적입니다. 이 문제를 극복하기 위해, 우리는 5,311명의 개인에서 비변형 말초혈액 샘플을 사용하여 발현 정량적 형질좌표(eQTL) 메타 분석을 수행했으며, 2,775명의 개인에서 재현했습니다. 우리는 이전에 유전체 수준의 유의성과 함께 복합 형질과 연관되어 있던 233개의 SNP(103개의 독립적인 좌표를 반영)에 대한 전이 eQTL을 식별하고 재현했습니다. 이러한 SNP 중 일부는 질병이 있는 개인에서 변화가 알려진 여러 유전자에 전이적으로 영향을 미칩니다: rs4917014는 전신 홍반 루푸스(SLE)와 이전에 연관되어 있으며, C1QB와 SLE의 두 가지 주요 특징인 다섯 개의 인터페론 유형 I 반응 유전자의 유전자 발현을 변화시킵니다. DeepSAGE RNA 시퀀싱은 rs4917014가 cis에서 IKZF1의 3' UTR 수준을 강하게 변화시킨다는 것을 보여주었고, 전이 조절 유전자의 크로마틴 면역침강 및 시퀀싱 분석에서 IKZF1이 인과 유전자로 확인되었습니다. 콜레스테롤 대사 및 제1형 당뇨병과 관련된 변형들도 유사한 현상을 보여주어 대규모 eQTL 매핑이 많은 형질 연관 변형의 하류 효과에 대한 통찰력을 제공함을 나타냅니다.
Westra et al. (Sun,)이 이 질문을 연구했습니다.