Key points are not available for this paper at this time.
단백질 정량화는 단백질체 전체 규모에서 중요한 목표로, 기본적인 세포 생물학에 대한 통찰을 가능하게 하고 실험 및 이론 모델에 제약을 가하는 역할을 합니다. 단백질체 전체 정량화는 아직 완전히 일상화되지는 않았지만, 생물물리학 및 질량 분석(MS) 기술을 통해 단백질체 전체 범위에 접근하는 많은 데이터 세트가 제공되고 있습니다. 이러한 유형의 데이터는 출판 보충 자료 및 온라인 데이터 저장소를 포함한 다양한 소스를 통해 접근할 수 있습니다. 그러나 데이터 접근은 여전히 단편적이며, 실험과 유기체 간의 비교는 간단하지 않습니다. 여기에서는 우리의 데이터베이스 자원 "PaxDb" (유기체 전반의 단백질 풍부성)에 대한 최근 업데이트를 설명합니다. PaxDb는 기초 측정 기술에 관계없이 단백질 풍부성 정보에 초점을 맞추고 있습니다. 정량화 데이터는 재처리되고 통합되어 질적 점수가 매겨지며, 메타 자원을 구축하기 위해 통합됩니다. PaxDb는 또한 미리 계산된 유전자 유사 관계를 통해 진화적 비교를 허용합니다. 최근 우리는 데이터베이스의 범위를 확대하여 세포주 샘플을 포함하고, 더 체계적으로 문헌을 스캔하여 적절한 데이터 세트를 조사했습니다. 우리는 발표된 실험의 상당 부분이 쉽게 접근할 수 없거나 정량적 정보를 추출할 수 없음을 보고하며, 이는 추가적인 단계와 노력이 필요함을 의미합니다. 현재 업데이트는 PaxDb를 53개 유기체의 414개 데이터 세트로 확장하며, 30만 개 이상의 단백질에 대한 (반)정량적 풍부성 정보를 포함합니다.
Wang et al. (목요일,)은 이 질문을 연구했습니다.