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올리고뉴클레오타이드 배열은 수천 개의 유전자 발현 수준을 동시에 모니터링함으로써 세포 상태에 대한 광범위한 그림을 제공할 수 있습니다. 결과 데이터 세트에서 유용한 정보를 추출하는 기술 개발이 관심사입니다. 본 연구에서는 서로 다른 세포 유형의 발현 패턴으로 이루어진 데이터 세트를 분석하기 위해 2방향 군집 분석 방법을 적용한 결과를 보고합니다. 40개의 종양 및 22개의 정상 대장 조직 샘플의 유전자 발현은 6,500개 이상의 인간 유전자에 상보적인 Affymetrix 올리고뉴클레오타이드 배열로 분석되었습니다. 효율적인 2방향 군집 알고리즘이 유전자와 조직 모두에 적용되어, 이러한 조직 내 유전자 발현 기반에 높은 조직화를 시사하는 광범위하고 일관된 패턴을 밝혀냈습니다. 조절이 함께 이루어지는 유전자 군들이 함께 군집화되었으며, 리보솜 단백질에서 이를 확인할 수 있었습니다. 군집 분석은 또한 개별 유전자의 발현이 조직 간에 약간만 차이나더라도 미묘하게 분포된 유전자 패턴을 바탕으로 암 조직과 비암 조직, 그리고 세포주와 생체 내 조직을 구분했습니다. 따라서 2방향 군집 분석은 유전자를 기능 그룹으로 분류하고 유전자 발현에 따라 조직을 분류하는 데 유용할 수 있습니다.
Alon et al. (Tue,)는 이 질문을 연구하였다.