g:Profiler—대규모 실험에서 유전자 리스트의 기능적 프로파일링을 위한 웹 기반 도구 세트

g:Profiler (http://biit.cs.ut.ee/gprofiler/)는 고처리량 유전체 데이터 마이닝에서 생성된 유전자 리스트를 특성화하고 조작하기 위한 공공 웹 서버입니다. g:Profiler는 Gene Ontology (GO), 경로 또는 전사 인자 결합 부위의 풍부함을 개별 유전자 수준까지 포착하기 위해 강력한 시각화를 제공하는 간단하고 사용자 친화적인 웹 인터페이스를 갖추고 있습니다. 표준 다중 테스트 보정 외에도 GO와 같은 복합 구조에 대한 다중 테스트의 실제 효과를 추정하는 새로운 개선된 방법이 도입되었습니다. 순위가 매겨진 유전자 리스트를 해석하는 것도 매우 효율적인 알고리즘으로 지원됩니다. 이러한 정리된 리스트는 고처리량 데이터에서 가장 유의미하게 영향을 받는 유전자 또는 쿼리 유전자와 함께 발현된 유전을 연구할 때 발생할 수 있습니다. g:Profiler와 밀접하게 통합된 모듈들이 실용적인 데이터 분석의 다른 중요한 측면도 지원합니다. 이러한 모듈들은 서로 다른 데이터베이스 식별자 간의 변환을 위한 g:Convert, 다른 종에서의 운동유전자를 찾기 위한 g:Orth, 그리고 공동 발현을 위한 공공 유전자 발현 데이터의 대규모 검색을 위한 g:Sorter입니다. g:Profiler는 31종의 다양한 종을 지원하며, 기본 데이터는 Ensembl 데이터베이스와 같은 출처에서 정기적으로 업데이트됩니다. g:Profiler와 통합하고자 하는 생물정보학 커뮤니티는 대체로 간단한 텍스트 출력을 사용할 수 있습니다.