Cardinal: 대량 분석 기반 이미징 실험을 위한 통계 분석 R 패키지

Cardinal은 조직과 같은 생물학적 샘플의 대량 분석 기반 이미징(MSI) 실험을 위한 통계 분석 R 패키지입니다. Cardinal은 Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization (MALDI) 및 Desorption Electrospray Ionization 기반 MSI 워크플로우를 지원하며, 여러 조직 및 복잡한 디자인의 실험을 지원합니다. 주요 분석 기능에는 (1) 이미지 세분화가 포함되며, 이는 조직을 동질적인 화학 조성의 영역으로 분할하고, 세그먼트의 수 및 정보가 많은 이온의 하위 집합을 선택하며, 관련된 불확실성을 특징짓습니다. (2) 이미지 분류는 조직의 위치를 사전 정의된 클래스에 할당하며, 정보가 많은 이온의 하위 집합을 선택하고, (교차) 검증을 통해 결과적인 분류 오류를 추정합니다. 통계 방법은 혼합 모델링 및 정규화에 기반합니다.