글로벌 5-hydroxymethylcytosine 함량은 조직 줄기/전구세포 구획과 인간 암에서 유의미하게 감소된다.

시토신의 5번 위치에서의 DNA 메틸화(5 mC)는 조직 분화에 관여하는 중요한 후천적 변형을 나타내며, 암에서 자주 변화를 겪는다. 최근 증거에 따르면, 5 mC는 TET 단백질 가족의 구성원들이 관여하는 효소 과정에서 5-hydroxymethylcytosine(5 hmC)로 전환될 수 있다. 이러한 5 hmC 변형은 배아 줄기 세포와 뇌의 DNA에서 널리 퍼져 있는 것으로 알려져 있지만, 대부분의 배아 및 성체 조직에서의 5 hmC 분포는 철저히 탐구되지 않았다. 여기에서는 5 hmC를 감지하기 위한 면역조직화학적 감지 방법과 이러한 기술을 대규모의 생쥐 및 인간 조직에서 5 hmC의 분포를 연구하는 데 적용하는 방법을 설명한다. 우리는 5 hmC가 대부분의 배아 및 성체 조직에서 풍부하다는 것을 발견했다. 또한, 5 hmC 수치는 계층적으로 조직화된 세포의 분화 상태와 밀접하게 관련되었다. 가장 높은 5 hmC 수치는 말단 분화 세포에서 관찰되었으며, 덜 분화된 조직 줄기/전구세포 구획은 매우 낮은 5 hmC 수치를 보였다. 더욱이, 5 hmC 수치는 정상 조직에 비해 전립선, 유방 및 대장 암에서 현저하게 감소되었다. 우리의 발견은 조직 분화에서 5 hmC의 명확한 역할을 제안하며, 암에서의 대규모 손실에 대한 증거를 제공한다.