2002년 SCOP 데이터베이스: 구조 유전체학을 수용하는 정제

SCOP(단백질의 구조적 분류) 데이터베이스는 진화적 및 구조적 관계에 따라 알려진 구조의 모든 단백질을 포괄적으로 정리한 것입니다. SCOP의 단백질 도메인은 종으로 그룹화되고 가족, 초가족, 접힘 및 클래스로 위계적으로 분류됩니다. 최근에, 우리는 데이터베이스 접근을 표준화하고 구조 유전체학 프로젝트에서 기대되는 증가하는 실험 구조를 관리할 수 있는 확고한 기반을 제공하기 위해 새로운 기능 세트를 도입했습니다. 이 기능에는 위계에서 각 항목을 고유하게 식별하는 새로운 식별자 세트; 단백질 도메인 분류의 간결한 표현; SCOP의 모든 도메인과 위계 자체를 완전히 설명하는 새로운 파서 가능한 파일 세트가 포함됩니다. 이러한 새로운 기능은 ASTRAL 요약집에 반영되어 있습니다. SCOP 검색 엔진도 업데이트되었으며, 도메인 항목 수준에서 외부 자원에 대한 링크 세트가 추가되었습니다. SCOP는 http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop에서 접근할 수 있습니다.