LOMETS: 단백질 구조 예측을 위한 로컬 메타 스레딩 서버

우리는 단백질 3차 구조 및 공간 제약에 대한 빠르고 자동화된 예측을 위해 로컬 스레딩 메타 서버인 LOMETS를 개발했습니다. 아홉 개의 최신 스레딩 프로그램이 설치되어 로컬 컴퓨터 클러스터에서 실행되며, 이는 전통적인 원격 서버 기반 메타 서버에 비해 초기 스레딩 정렬의 빠른 생성을 보장합니다. 합의 모델은 구성 요소 스레딩 서버의 상위 예측에서 생성되며, 이는 TM-score를 기준으로 t-test 유의성 수준 0.1%에서 최상 개별 서버보다 최소 7% 더 정확합니다. 또한, 측쇄 및 C-alpha(C(alpha)) 접촉은 각각 42%와 61%의 정확도로 자동적으로 구성되며, 장거리 및 단거리 거리 지도도 스레딩 정렬에서 자동으로 구성됩니다. 이러한 데이터는 TASSER와 같은 ab initio 절차를 안내하기 위한 제약으로 쉽게 사용될 수 있습니다. LOMETS 서버는 http://zhang.bioinformatics.ku.edu/LOMETS에서 학계에 무료로 제공됩니다.