마우스 혈소판 프로테옴의 복제 수 분석: 전체 풍부성 범위 포괄

세포 유형의 발현된 단백질의 정체성과 양에 대한 지식은 그 분자의 기능을 완전히 이해하기 위한 전제 조건입니다. 질량 분석 기반의 프로테오믹스는 효모의 전체 단백질 보완체와 포유류 세포주에서 발현되는 거의 완전한 단백질 세트를 식별할 수 있게 해주었습니다. 최신 기술적 발전을 이용하여, 우리는 지혈 및 혈전 형성을 매개하는 주요 역할을 하는 마우스 혈소판의 프로테옴을 특성화했습니다. SILAC 단백질 표지 서명 태그를 사용하여 13개의 혈소판 단백질의 절대 단백질 농도를 정확하게 측정하고 이를 기준점으로 사용하여 혈소판 프로테옴의 모든 단백질의 복제 수를 추정했습니다. 또한, 혈장이나 적혈구 단백질과 같은 오염 물질과 실제 혈소판 단백질을 구별하기 위해 여러 정제 단계에서 단백질 풍부도 프로필을 모니터링했습니다. 총 4,400개의 혈소판 단백질을 절대 정량화했으며, 추정 복제 수는 세포당 10 미만에서 약 100만까지 다양합니다. 우리 데이터에서 도출된 화학량론은 이전 연구들과 잘 일치합니다. 우리의 연구는 인류 혈소판 질환의 생쥐 모델을 해석하는 데 유용할 수 있는 혈소판 단백질의 거의 완전한 참조 지도를 제공합니다.