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DCSE는 서열 정렬의 생성 및 수정을 위한 사용자 친화적인 패키지를 제공합니다. 이 프로그램은 마이크로 컴퓨터 및 워크스테이션을 포함한 다양한 플랫폼에서 실행됩니다. 사용 가능한 하드웨어 외에도, 프로그램은 처리할 수 있는 정렬의 크기에 제한이 없습니다. 편집 방법이 다르기 때문에 다른 서열 편집기와는 다르게 고전적인 텍스트 편집기와 더 많은 차이를 보입니다. 이 도구는 서열의 공백을 삽입하거나 삭제하는 대신 정렬된 문자나 전체 블록을 이동합니다. 새로운 서열을 기존의 정렬에 맞추는 작업은 부분적으로 자동화되어 있습니다. DCSE는 단백질 서열 정렬에도 사용할 수 있지만, RNA 검토를 위해 특별히 목표로 하고 있습니다. 모든 서열의 2차 구조는 정렬에 쉽게 통합될 수 있습니다. DCSE는 2차 구조 요소를 찾고 확인하기 위한 광범위한 내장 지원도 제공합니다. 복잡한 표식 시스템은 정렬에서 특수 위치를 기록할 수 있게 합니다. 이 시스템은 숨겨진 중단, 인트론, 및 제3 구조 상호작용의 위치와 같은 정보를 저장하는 데 사용할 수 있습니다.
Rijk et al. (1993)은 이 문제를 연구했습니다.