기계 학습 및 생물학적 평가 기반 MMP-9 억제제의 식별, 난소암 세포 SKOV3에 효과적

MMP-9, 젤라틴 분해효소 B로도 알려진, 세포외 기질(ECM)의 분해에서 중요한 역할을 하는 아연-메탈로단백질 효소 가족 단백질이다. MMP-9의 정상적인 기능은 ECM의 분해를 포함하며, 이는 배아 발달, 혈관 생성 등과 같은 정상 생리적 과정에 도움을 준다. MMP-9의 과발현이나 억제으로 인해 이러한 과정에 중단이 발생하면 신경퇴행성 질환 및 암과 같은 일부 병리적 상태를 유발한다고 보고되었다. 본 연구에서는 Maybridge 라이브러리의 ML 기반 가상 스크리닝을 위한 통합 접근법을 수행하고, MMP-9의 활성을 억제할 수 있는 새로운 소분자 스캐폴드를 식별하기 위해 그들의 생물학적 활성을 테스트했다. 최상위 히트가 식별되어 MMP-9 단백질에 대한 타겟 기반 활성화를 위해 선택되었으며, 이 과정에서 Biovision K844 키트가 사용되었다. 또한, MTT 분석이 유방암(MCF-7, MDA-MB-231), 대장암(HCT119, DL-D-1), 자궁경부암(HeLa), 폐암(A549) 및 난소암(SKOV3)와 같은 다양한 암 세포주에서 수행되었다. 흥미롭게도 RJF02215라는 하나의 화합물이 SKOV3에서 선택적으로 항암 활성을 나타냈다. RJF02215 존재 하에 SKOV3 세포주에서 수행된 상처 치유 분석 및 집락 형성 분석은 이 화합물이 이 세포주에서 상당한 억제 효과를 미친 것을 확인했다. 따라서 우리는 MMP-9 활성을 vitro에서 억제하고 SKOV3 세포의 증식을 억제할 수 있는 새로운 분자를 식별하였다. RJF02215 구조를 기반으로 하는 새로운 분자는 선택적인 MMP-9 활성을 나타내어 난소암 치료에 좋은 부가가치를 더할 수 있을 것이다. Ramaswamy H. Sarma가 전달함