다종 보존 서열의 식별 및 특성화

비교 서열 분석은 유전체 기능을 밝히기 위한 연구의 필수 요소가 되었습니다. 여러 척추동물로부터 유전자가 증가하고 있어, 강력한 방식으로 높은 보존 영역을 감지할 수 있는 계산 방법의 필요성이 커지고 있습니다. 이를 위해 우리는 여러 종에서 보존된 서열을 식별하는 방법을 개발하고 있으며, 이를 "다종 보존 서열"(MCSs)이라고 부릅니다. 여기서는 MCS 식별을 위한 두 가지 전략을 보고하며, 이들이 알려진 모든 활동적으로 보존된 서열(특히, 코딩 서열)을 감지할 수 있는 능력을 보여줍니다. 그에 비해 중립적으로 진화하는 서열(특히, 조상 반복)은 거의 감지되지 않습니다. 무엇보다도, MCS 내의 기저의 상당 부분(약 70%)이 비코딩 영역에 위치하고 있음을 발견했습니다. 따라서 여러 척추동물 종 간에 보존된 서열의 대부분은 알려진 기능이 없습니다. 이러한 MCS의 초기 특성화는 전사 인자 결합 위치 클러스터, 비코딩 RNA 전사체 및 기타 후보 기능 요소에 해당하는 서열을 밝혔습니다. 마지막으로, MCS를 감지하는 능력은 특정 종의 서열이 관심 있는 유전체 영역을 식별하는 데 기여하는 상대적 기여도를 평가하는 귀중한 지표를 나타내며, 우리의 결과는 현재 사용 가능한 유전체 서열이 인간 유전체에서 MCS를 포괄적으로 식별하기에 불충분함을 나타냅니다.