E. coli, B. subtilis, 파지 SP01 및 파지 T4의 시그마 인자는 동종 단백질입니다.

우리는 점 행렬 비교와 서열 정렬의 통계 분석을 사용하여, 일곱 개의 서열화된 시그마 인자, E. coli 시그마-70 및 시그마-32, B. subtilis 시그마-43 및 시그마-29, 파지 SP01 유전자 산물 28 및 34, 그리고 파지 T4 유전자 산물 55가 동종 단백질의 가족을 구성한다는 것을 보여줍니다. 시그마-70, 시그마-32, 및 시그마-43은 각각 CRP, 람다 억제자 및 크로 단백질에서 나타나는 헬릭스-턴-헬릭스 DNA 결합 모티프와 유사한 서열을 두 개 포함하고 있습니다. B. subtilis 시그마-29, SP01 gp28 및 SP01 gp34는 이 서열과 유사한 최소한 하나의 복사를 가지고 있습니다. 우리는 모든 일곱 단백질에서 보존된 두 번째 서열이 핵심 RNA 중합효소 결합 부위라고 제안합니다. 시그마-70과 시그마-43에서만 존재하는 세 번째 영역은 핵심과의 상호작용에도 관여할 수 있습니다. 사용 가능한 돌연변이 증거는 시그마 인자 구조에 대한 우리의 모델을 지지합니다.