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RADARS는 고처리량 단백질체 질량 분광 데이터 처리 및 저장을 위한 신속하고 자동화된 데이터 아카이빙 및 검색 소프트웨어 시스템입니다. 대부분의 질량 분석 데이터 파일은 일관된 처리를 위해 RADARS와 호환됩니다. 이 시스템은 자동으로 처리되지 않은 데이터 파일을 가져와 인실리코 데이터베이스 검색을 통해 단백질을 식별한 후, 처리된 데이터와 검색 결과를 사용자 정의 보고서에 적합한 관계형 데이터베이스에 저장합니다. 이 시스템은 견고하며 24시간 운영에 사용 가능합니다. 웹 브라우저를 통해 인트라넷의 여러 사용자에게 접근 가능하며, 가상 사설망(VPN)을 통해 모니터링할 수 있고, 보안이 확보되어 있습니다. RADARS는 하나의 컴퓨터에서 또는 여러 컴퓨터에서 사용할 수 있게 확장 가능하며, 다중 프로세서 시스템에 적합합니다. FASTA 형식의 모든 로컬 데이터베이스를 통합할 수 있으며, 온라인에서 단백질 및 DNA 데이터베이스를 검색할 수 있습니다. 주요 기능은 스펙트럼을 쉽게 조작할 수 있게 해주는 시각화 도구의 집합(많은 도구가 무료로 제공됨)입니다. 이를 통해 수동 주석, 재분석 및 모든 절차에 대한 접근이 가능합니다. 우리는 또한 모든 6개 리딩 프레임으로 번역된 유전체 또는 EST 데이터베이스에 대해 검색을 위해 프로세스당 40MB RAM을 요구하는 신규의 신속한 검색 엔진인 Sonar MS/MS의 사용을 설명했습니다. RADARS는 효율적인 알고리즘을 통해 분석 비용을 줄입니다: Sonar MS/MS는 부모 이온 질량에 대한 정확한 지식 없이 그리고 단백질 태그 없이 단백질을 식별할 수 있습니다. 통계적 채점 방법은 전문가 수준의 정확성을 제공하며 비전문가 사용자에게 강력한 데이터 분석을 제공합니다.
Field et al. (화요일) 이 질문에 대해 연구했습니다.
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