임계 논리를 이용한 쌍별 유전자 상호작용 예측

계산 생물학의 두 가지 중요한 문제는 유전자 조절 네트워크 모델링과 복잡한 생물학적 시스템의 네트워크 구조 연구입니다. 이 두 가지 문제를 해결하기 위해 수학적 및 계산 이론 기법의 사용이 증가하고 있습니다. 부울 회로 모델은 유전자 조절 네트워크 모델링에 사용되는 가장 인기 있는 모델링 패러다임 중 하나입니다. 본 논문에서는 디지털 회로 설계를 위한 부울 논리의 대안인 임계 논리의 속성을 활용하여 유전자 시스템의 네트워크 구조를 결정하려고 합니다. 이 접근법은 마이크로어레이 실험의 유전자 발현 데이터를 입력으로 사용합니다. 제안된 방법은 먼저 인 실리코 데이터에 기반하여 유전자, 단백질 및 기타 분자 구성 요소의 집합에 대한 유전자 네트워크를 구축하는 데 사용되었습니다. 그 다음, 이 방법은 생물학적 데이터셋에 적용되어 멜라노마와 관련된 핵심 유전자 집합에 대한 유전자 조절 네트워크를 구축했습니다. 발견된 상호작용 중 일부는 발표된 문헌에 보고된 이전 생물학적 실험에 의해 검증될 수 있었습니다. 기존 생물학적 지식으로 검증할 수 없는 다른 상호작용은 멜라노마 발달과 관련된 생화학 경로 조사에 대한 통찰력을 제공할 수 있습니다.