ScRAPdb: Saccharomyces cerevisiae 기준 조립 패널을 위한 통합 팬-오믹스 데이터베이스

단세포 진핵생물인 피어리 효모(Saccharomyces cerevisiae)는 생물학적 복잡성과 실험적 처리 가능성 사이에서 독특한 균형을 이루며, 기본 및 응용 연구를 위한 오랜 고전 모델로 자리잡고 있습니다. 최근 S. cerevisiae는 유전자 진화의 자연 다양성을 연구하고 인구 규모에서의 관련 기능적 의미를 탐구하는 주요 시스템으로 부각되었습니다. 이러한 노력을 위해서는 고품질 비교 및 기능 유전체 데이터가 매우 중요합니다. 여기에서는 우리가 이전에 142주의 효모에 대해 구축한 끝에서 끝까지(telomere-to-telomere, T2T) S. cerevisiae 기준 조립 패널(ScRAP)을 철저히 확장하여, 다양한 지리적 및 생태적 환경에서 264개의 S. cerevisiae 균주의 고품질 유전체 조립 및 주석을 포함하고, 다른 Saccharomyces 종 복합체의 33개의 외부 균주를 아우르게 되었습니다. 우리는 이 확장된 팬유전체 모음을 호스팅하기 위해 전용 온라인 데이터베이스인 ScRAPdb(https://www.evomicslab.org/db/ScRAPdb/)를 만들었습니다. 더욱이 ScRAPdb는 인구 규모 팬-오믹스 아틀라스(pantranscriptome, panproteome 및 panphenome)와 직관적인 유전체 분석을 위한 방대한 데이터 탐색 도구 키트도 통합합니다. 모든 큐레이션된 데이터 및 하위 분석 결과는 ScRAPdb에서 쉽게 다운로드할 수 있습니다. 우리는 ScRAPdb가 효모 커뮤니티 및 그 이상을 위한 매우 가치 있는 플랫폼이 되어, 전 세계의 유전적 및 표현형 다양성에 대한 팬-오믹스 이해를 이끌어낼 것으로 기대합니다.