인간 응고 촉진제인 조직 인자(Tissue Factor)를 표적하는 짧은 간섭 RNA의 위치적 효과

화학적으로 합성된 21-23 bp 이중 가닥 짧은 간섭 RNA(siRNA)는 RNA 간섭(RNAi)이라고 하는 과정에서 서열 특이적 전사 후 유전자 침묵을 유도할 수 있다. 본 연구에서는 동일한 표적 mRNA(인간 조직 인자)에 대해 서로 다른 부위에서 합성된 여러 개의 siRNA가 침묵 효율성에서 현저한 차이를 보였다. 몇몇 siRNA만이 발현의 상당한 감소를 초래했으며, 이는 접근 가능한 siRNA 표적 부위가 일부 인간 mRNA에서 드물 수 있음을 시사한다. FITC로 3'-OH을 차단해도 표적 mRNA에 대한 효과가 줄어들지 않았다. 표적 mRNA 서열에 대한 siRNA의 돌연변이는 점진적으로 mRNA 고갈을 감소시켰지만, 이를 없애지는 않았다. 비활성 siRNA는 서열 독립적인 방식으로 활성 siRNA와 가역적으로 경쟁했다. 몇 가지 증거는 mRNA 생산과 siRNA 매개 mRNA 고갈 사이에 거의 평형 동역학 균형이 존재함을 시사한다. 침묵 효과는 일시적이며, mRNA 수준은 4-5일 이내에 완전히 회복되어 인간에서 RNAi의 전파 시스템이 없음을 시사한다. 마지막으로, 가장 효과적인 siRNA의 작용으로 인한 3' mRNA 절단 조각을 관찰했다. 이러한 조각의 고갈 속도 의존적 출현은 두 단계의 mRNA 분해 메커니즘의 존재를 주장한다.