세균 단백질이 단일 진핵 뿌리를 정확히 지정하다

진핵 유전자와 그 고세균 동형유전자 간의 큰 계통 발생 거리는 계통유전체 연구에서 진핵 뿌리의 위치를 식별하는 것을 방해했습니다. 최근, 이 문제를 해결하기 위해 혁신적인 접근 방식이 제안되었습니다: 고세균에서 진핵생물로의 출현 이후, 세균 기증원에서 전이된 단백질을 계통발생 마커로 사용하는 것입니다. 이 접근법을 사용하여, 두 개의 최근 독립 연구는 세균 염기서열을 기반으로 한 계통유전체 데이터를 구축하였으며, 이는 진핵 뿌리에 대한 다른 예측으로 이어졌습니다. 우리의 추가 유전체 염기서열인 jakobid Andalucia godoyi와 두 가지 알려진 말라위모나드 종(Malawimonas jakobiformis 및 Malawimonas californiana)을 활용하여 이 두 계통유전체 데이터를 재분석했습니다. 우리는 두 데이터 세트 모두 진핵 뿌리의 동일한 계통 발생 위치를 지정하며, 이는 "Unikonta"와 "Bikonta" 사이에 위치하고, 말라위모나드 및 콜로디크티온이드 계통이 뿌리의 Unikonta 쪽에 위치함을 보여줍니다. 우리의 결과는 (i) 초그룹 Excavata가 단일 계통이 아님을, (ii) 진핵생물의 마지막 공통 조상이 두 깃털 유기체였음을 확고히 나타냅니다. 우리의 결과를 바탕으로, 두 개의 주요 진핵 생물 그룹인 Unikonta와 Bikonta의 이름을 각각 Opimoda와 Diphoda로 변경할 것을 제안합니다.