DNA polymerase beta-like nucleotidyltransferase 슈퍼패밀리: 세 가지 새로운 패밀리의 식별, 분류 및 진화 역사

폴베타 슈퍼패밀리의 뉴클레오타이드 전이 효소에 대한 상세한 분석이 반복적 데이터베이스 검색, 다중 정렬, 모티프 분석, 구조 모델링을 위한 컴퓨터 방법을 사용하여 수행되었습니다. 이전에 특성이 규명되지 않은 세 가지 뉴클레오타이드 전이 효소 가족이 설명됩니다. 이 새로운 가족 중 하나는 모든 고균과 일부 박테리아에서 발견되는 작은 단백질로 구성되어 있으며, 최소한의 뉴클레오타이드 전이 효소 도메인으로 구성되어 있는 것으로 보이며 이 슈퍼패밀리의 조상 상태를 닮고 있을 가능성이 있습니다. 또 다른 새로운 가족은 진핵생물 폴리A 중합효소와 특별히 관련이 있으며, 크로마틴 리모델링에 참여하는 효모 Trf4p 및 Trf5p 단백질로 유형화됩니다. TRF 가족은 모든 진핵생물에서 여러 구성원으로 나타나며, 크로마틴 구조 유지에 필요한 아직 알려지지 않은 뉴클레오타이드 중합 반응에 관여할 수 있습니다. 또 다른 새로운 가족의 세균 및 고균 뉴클레오타이드 전이 효소는 신호 전달에서 기능할 것으로 예측되며, 뉴클레오타이드 전이 효소 도메인 외에도 리간드 결합 도메인을 포함하고 있습니다. 감마 프로테오박테리아 아데닐릴 사이클레이스의 촉매 도메인이 폴베타 슈퍼패밀리의 뉴클레오타이드 전이 효소와 상동이라는 것이 추가로 보여지며, 이는 신호 전환 효소의 기원이 복제, 복구 및 RNA 처리에 관여하는 효소에서 유래된다는 일반적인 경향을 강조합니다. 폴베타 슈퍼패밀리를 독특한 패밀리로 분류하고 그 계통 분포를 조사한 결과, 이러한 유형의 뉴클레오타이드 전이 효소의 진화에 새로운 기능의 출현과 관련된 급속한 분기 폭발 및 여러 수평 유전자 전이 사건이 포함되었을 수 있음을 제안합니다.