4-플렉스 드롭릿 디지털 PCR을 이용한 유방암 아형 분류

초록 배경 침습성 유방암의 가장 일반적인 형태는 침윤성 관암종(IDCA)입니다. 면역조직화학(IHC)은 종양을 분류하고 의학적 치료를 안내하는 데 도움이 되는 에스트로겐 수용체 1(ER), 프로게스테론 수용체(PR) 및 인간 상피세포 성장인자 수용체 2(HER2)를 분석하는 데 널리 사용됩니다. IHC 검사는 경험이 많은 병리학자가 주관적인 해석을 제공해야 하므로 IHC 기반 진단의 재현성이 떨어집니다. 이 연구에서는 포르말린 고정 파라핀 포함(FFPE) 샘플에서 에스트로겐 수용체 1(ESR1), 프로게스테론 수용체(PGR), erb-b2 수용체 타이로신 키나제 2(ERBB2), 및 pumilio RNA 결합 패밀리 구성원 1(PUM1)의 발현 수준을 동시에 정량적으로 분석하기 위해 4-플렉스 드롭릿 디지털 PCR(ddPCR)을 개발했습니다. 방법 4-플렉스 ddPCR의 민감도, 재현성 및 선형 동적 범위를 평가했습니다. 이 방법을 사용하여 유방 IDCA 환자의 95개의 FFPE 샘플을 분석하고 ddPCR과 IHC 간의 일치율을 평가하여 유방암 아형 분류에 대한 잠재력을 평가했습니다. 결과 정량화 한계(LOQ)는 ERBB2, ESR1, PGR 및 PUM1에 대해 각각 반응당 25, 50, 50 및 50 복사본이었습니다. ESR1, PGR 및 PUM1의 동적 범위는 반응당 50-1600 복사본에 걸쳐 있으며, ERBB2는 25-1600 복사본 범위였습니다. 4-플렉스 ddPCR과 IHC 간의 일치 상관계수는 각각 ERBB2, ESR1 및 PGR에 대해 96.8%, 91.5%, 및 85.1%였습니다. 수신자 작동 특성 곡선 아래 면적 값은 각각 ERBB2, ESR1 및 PGR에 대해 0.991, 0.977, 및 0.920이었습니다. 결론 4-플렉스 ddPCR에 의한 유방암 바이오마커 상태의 평가는 본 연구에서 IHC와 높은 일치를 보였습니다.