969개 옥수수 양친 집단 내 전 유전체 예측 정확도

초록 전 유전체 선택에서 예측된 유전자형 값과 실제 유전자형 값 간의 예상 상관관계 (r MG)는 이전에 훈련 집단 크기 (N), 유전력 (h²) 및 형질에 영향을 미치는 염색체 구간의 효과적인 수 (M e)의 함수로 도출되었습니다. 우리의 목표는 다음과 같은 사항을 확인하는 것이었습니다: (i) 7가지 형질에 대한 969개의 양친 옥수수 (Zea mays L.) 육종 집단에서의 r MG의 평균 및 변동성, (ii) r MG를 사전에 예측할 수 있는지 여부, (iii) N, h² 및 마커 수 (N M)가 r MG에 미치는 영향. 우리는 마커와 양적 형질좌위 (QTL) 간의 연관 불균형 (r²)을 고려하기 위해 예상 r MG에 대한 이전의 방정식을 수정했습니다. 969개 집단에서 관찰된 r MG의 평균 및 범위(괄호 안)는 수량 수확량에 대해 0.45 (−0.59, 1.03), 수분에 대해 0.59 (−0.34, 0.96), 시험 체중에 대해 0.55 (−0.24, 1.10), 줄기 기울기에 대해 0.49 (−0.22, 1.04), 뿌리 기울기에 대해 0.41 (−0.30, 0.93), 식물 높이에 대해 0.47 (−0.45, 0.97), 그리고 이삭 높이에 대해 0.42 (−0.43, 0.94)였습니다. 관찰된 r MG 값은 r²을 고려했을 때 예상 r MG 주위에 중앙에 위치했지만, 관찰된 r MG는 예상 r MG 주위에 큰 분포를 보였습니다. r²(Nh²)¹/²는 관찰된 r MG와 가장 강한 연관성을 보였습니다. r²(Nh²)¹/²가 8을 초과하면 r MG가 0.50 이상인 비율이 모든 집단-형질 조합 중 90%에 도달했습니다. 우리는 r MG를 사전에 예측하기 어렵다고 결론짓지만, r²(Nh²)¹/²에 기반한 경험법칙이 높은 r MG를 달성하는 데 도움이 될 수 있음을 확인했습니다.