Key points are not available for this paper at this time.
공간적으로 해상된 전사체학은 온전한 장기의 공간 구조와 조직 항상성, 발달 및 질병을 매개하는 공간적으로 해상된 세포-세포 통신을 밝히기 위한 공간 내 유전 정보를 제공합니다. 공간적으로 해상된 세포-세포 통신의 추론을 용이하게 하기 위해, 우리는 SpaTalk을 제시합니다. 이는 그래프 네트워크와 지식 그래프에 의존하여, 비부정 선형 모델과 단일 세포 전사체학 데이터와 공간적으로 해상된 전사체 데이터 간의 공간 매핑을 통해 세포 유형 구성을 해부하여 공간적으로 인접한 세포 간의 리간드-수용체-표적 신호 전달 네트워크를 모델링하고 점수를 매깁니다. 공개된 단일 세포 공간 전사체 데이터세트에서 SpaTalk의 벤치마크 성능은 기존 추론 방법보다 우수합니다. 그러고 나서 우리는 SpaTalk을 STARmap, Slide-seq, 및 10X Visium 데이터에 적용하여 공간적 구조를 가진 정상 및 질병 조직의 깊은 통신 메커니즘을 드러냅니다. SpaTalk은 단일 세포 및 점 기반의 공간적으로 해상된 전사체 데이터에 대한 공간적으로 해상된 세포-세포 통신을 보편적으로 밝혀내어, 공간적 세포 간 조직 동역학에 대한 귀중한 인사이트를 제공합니다.
Shao et al. (Sat,)은 이 질문을 연구했습니다.