Tetrahymena 자가 스플라이싱 rRNA 인트론에서 3′ 엑손과 내부 가이드 서열 간의 염기 쌍이 3′ 스플라이스 사이트 특이성을 증가시킨다.

많은 그룹 I 인트론에서 3' 스플라이스 사이트의 인식은 3' 엑손의 시작과 내부 가이드 서열로 알려진 인트론의 영역 간의 염기 쌍 형성과 관련이 있다고 제안되어왔다 (R. W. Davies, R. B. Waring, J. Ray, T. A. Brown, C. Scazzocchio, Nature London 300:719-724, 1982). 우리는 Tetrahymena thermophila의 자가 스플라이싱 rRNA 인트론을 사용하여 이 가설을 조사했다. 이 제안된 염기 쌍 형성을 약화시키는 3' 엑손의 돌연변이는 하류의 숨은 3' 스플라이스 사이트 사용을 증가시켰다. 이 염기 쌍 형성을 회복하는 가이드 서quence에서의 보상적인 돌연변이는 정상적인 3' 스플라이스 사이트의 선택을 더욱 강하게 만들었다. 3' 스플라이스 사이트 사용의 이러한 변화는 인트론의 마지막 염기가 구아닌 대신 아데닌인 돌연변이(414A)가 있는 배경에서 더욱 뚜렷하게 나타났다. 이러한 결과는 제안된 염기 쌍 형성(P10)이 숨은 3' 스플라이스 사이트가 선택되지 않도록 보장하는 데 중요한 역할을 한다는 것을 보여준다. 놀랍게도, 414A 돌연변이 단독으로는 숨은 3' 스플라이스 사이트의 활성화를 초래하지 않았다.